SMAN 2 Bondowoso adalah salah satu SMA Negeri yang menggunakan sistem SKS (Sistem Kredit Semester) dalam menempuh mata pelajarannya. Siswa siswi yang memiliki kemampuan untuk belajar lebih cepat dari rekan rekannya di jenjang yang sama dapat lebih cepat menyelesaikan seluruh beban belajar di Semester 1 tahun pelajaran 2019/2020. Pada akhir Oktober 2019, 10 orang tua siswa hadir di sekolah untuk menerima laporan hasil belajar siswa yang telah menyelesaikan seluruh kompetensi dasar untuk seluruh mata pelajaran di semester 1 ini. 

Diharapkan siswa siswi ini dapat menyelesaikan belajar di SMAN 2 Bondowoso dalam waktu 2 tahun dan dapat bersaing dan diterima di Perguruan Tinggi ternama di Indonesia.